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共生微生物
与其他生物长久生活在一起的微生物。如人体内的大肠杆菌、豆科植物的根瘤菌、地衣的真菌与蓝藻等。
共生可分为以下四种：①寄生，一种生物寄附于另一种生物，利用被寄附的生物的养分生存。②互利共生，对共生的生物体成员彼此都有利。③偏利共生，对其中一方生物体有益，但对另一方没有影响。④偏害共生，对其中一方生物体有害，对其他共生的成员则没有影响。
根据共生微生物对宿主的影响，可将其分为：①寄生者（对宿主有一定影响）。②致病者（会使宿主生病）。③共餐者（对宿主无明显影响）。④互利者（与宿主互利共生）。动物胃肠道中的微生物群落非常复杂，既存在有利菌也存在有害菌。如肠道微生物对人体肠道器官的健康非常重要，人的皮肤表面也有微生物群，它们是免疫系统第一防线的重要组成部分，如表皮葡糖球菌（Staphylococcus epidermidis）能产生抗菌肽（AMPs）。人体肠道中核心主导菌群与膳食模式中蛋白质、脂肪和糖类成分的比例有关，拟杆菌属（Bacteroides）在长期以蛋白质和脂肪为主要膳食成分的人群中占主导地位，而在以碳水化合物、膳食纤维类、植物性饮食为主要膳食成分的人群中，普氏菌属（Prevotella）则占核心地位。
